本校依各系所專業領域的特性,統合相關資源,配合地方需求,近、中、遠程目標共規劃師範、人文、理工等三個學院,其他學院未來視需要再繼續規劃。
臺東大學在作育教育英才之外,將配合台東觀光休閒、民族藝術、南島文化、人文自然景觀及體育發展,發展為具有地方特色的學府,帶動地方繁榮,提升地方教育文化水準,以後更將發展成區域性、國際性的綜合性大學。